Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NOTCH2Q04721 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NOTCH2Q04721 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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