Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A3Q01959 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms