Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ERVS71-1P61550 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVS71-1P61550 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms