Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FAM3BP58499 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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