Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME5P56597 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME5P56597 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME5P56597 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NME5P56597 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms