Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ARFIP1P53367 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms