Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms