Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GSK3BP49841 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms