Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGS4P49798 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGS4P49798 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGS4P49798 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms