Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TTPAP49638 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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