Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNTAP49354 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNTAP49354 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms