Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX1P48742 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX1P48742 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX1P48742 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms