Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITPNBP48739 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms