Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARL1P40616 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARL1P40616 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARL1P40616 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms