Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZEB1P37275 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms