Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHRNA7P36544 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHRNA7P36544 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms