Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5C1P36542 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms