Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
MARCKSP29966 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MARCKSP29966 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms