Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HRCP23327 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HRCP23327 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HRCP23327 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HRCP23327 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HRCP23327 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HRCP23327 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HRCP23327 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HRCP23327 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HRCP23327 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms