Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms