Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABRB1P18505 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms