Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DESP17661 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DESP17661 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DESP17661 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DESP17661 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DESP17661 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DESP17661 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms