Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRG2P13727 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRG2P13727 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms