Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMP3P12645 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMP3P12645 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMP3P12645 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms