Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GLI4P10075 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GLI4P10075 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GLI4P10075 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GLI4P10075 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms