Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI3P10071 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLI3P10071 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLI3P10071 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms