Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOP08100 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOP08100 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOP08100 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOP08100 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms