Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFMP07197 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFMP07197 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFMP07197 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 512.5 ms