Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTAP01040 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTAP01040 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTAP01040 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTAP01040 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms