Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H3BNH8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H3BNH8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H3BNH8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3BNH8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms