Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NPIPB9F8W1W9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPIPB9F8W1W9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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