Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C5orf60A6NFR6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms