Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPS28Q9Y2Q9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms