Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TTF2Q9UNY4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTF2Q9UNY4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms