Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms