Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms