Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms