Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms