Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms