Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCMF1Q9P0J7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms