Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP29Q9HBJ7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms