Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCL11BQ9C0K0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCL11BQ9C0K0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms