Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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