Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms