Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms