Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPOCK3Q9BQ16 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SPOCK3Q9BQ16 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPOCK3Q9BQ16 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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