Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD8Q96LT4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms