Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UTP4Q969X6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms