Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAPGEF4Q8WZA2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms