Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GIPC3Q8TF64 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms